Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubfd1Q78JW9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubfd1Q78JW9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubfd1Q78JW9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubfd1Q78JW9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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