Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GcsamQ6RFH4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms