Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms