Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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