Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms