Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atg9aQ68FE2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9aQ68FE2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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