Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kiaa1549Q68FD9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms