Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Sbno1Q689Z5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sbno1Q689Z5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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