Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift88Q61371 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ift88Q61371 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ift88Q61371 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ift88Q61371 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift88Q61371 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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