Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms