Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CttnQ60598 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms