Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms