Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rbm44Q3V089 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm44Q3V089 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms