Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms