Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms