Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms