Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RubcnlQ3TD16 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RubcnlQ3TD16 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms