Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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