Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cers3Q1A3B0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms