Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ptchd1Q14B62 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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ptchd1Q14B62 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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