Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms