Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calb2Q08331 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms