Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr5Q04683 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms