Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1sQ02789 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms