Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms