Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms