Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabpb2P81069 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms