Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NfixP70257 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NfixP70257 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NfixP70257 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NfixP70257 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms