Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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