Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GferP56213 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GferP56213 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
GferP56213 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms