Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Epb42P49222 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Epb42P49222 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms