Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gli1P47806 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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