Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtbP41155 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtbP41155 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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LtbP41155 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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LtbP41155 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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LtbP41155 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LtbP41155 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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