Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tjp1P39447 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms