Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CftrP26361 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CftrP26361 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CftrP26361 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CftrP26361 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CftrP26361 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms