Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Spta1P08032 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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