Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01853 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01853 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01853 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms