Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lhx8O35652 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms