Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ArxO35085 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ArxO35085 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ArxO35085 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ArxO35085 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms