Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AlyrefO08583 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AlyrefO08583 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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