Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms