Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cldn34c3J3QJW5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cldn34c3J3QJW5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cldn34c3J3QJW5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cldn34c3J3QJW5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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