Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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