Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ScaperF8VQ70 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ScaperF8VQ70 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms