Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms