Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc170D3YXL0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc170D3YXL0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc170D3YXL0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc170D3YXL0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc170D3YXL0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc170D3YXL0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc170D3YXL0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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