Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2B9EJA2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cttnbp2B9EJA2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms