Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfap58B2RW38 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms