Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn2B2RVW2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms