Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Prrt4B2RU40 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms